O Brasão é composto pela coroa régia, no topo, que representa a origem régia da Instituição. Por baixo apresenta dois escudos ovalados: o da direita tem as armas de Portugal, que simbolizam o carácter nacional das Misericórdias; o da esquerda, em campo azul, integra uma cruz latina, com resplendor de prata, que significa Cristo Redentor, sustento e conforto dos doentes e desprotegidos. Esta última é ladeada pela abreviatura simbólica “MIZA”, antiga abreviatura de Misericórdia. Por baixo, também em prata, uma caveira com duas tíbias, representando a morte, símbolo de enterrar os mortos, uma das obras da misericórdia. As cores também têm significado: o fundo em azul representa a probidade, a integridade e o zelo permanente e a prata a humildade e a esperança de melhor servir.
Os escudos são encimados por ramos de lírios, que significam pobreza, e, lateralmente, por ramos com folhas de acanto estilizadas, que representam o esforço, a dedicação e a sabedoria dos que trabalham em prol dos desfavorecidos. Por baixo, duas estrelas de oito pontas, que simbolizam a Virgem Maria, Mãe de Cristo e da Igreja, de acordo com a antiga tradição heráldica.